Arabidopsis thaliana regulatory element analyzer
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Arabidopsis thaliana regulatory element analyzer
UNLABELLED In the Arabidopsis thaliana regulatory element analyzer (AtREA) server, we have integrated sequence data, genome-wide expression data and functional annotation data in three application modules which will be useful to identify major regulatory targets of a user-provided cis-regulatory element (CRE), study different features of CRE distribution and evaluate the role of a set of CREs i...
متن کاملCis-regulatory element based gene finding: an application in Arabidopsis thaliana.
Using cis-regulatory motifs known to regulate plant osmotic stress response, an artificial neural network model was built to identify other functionally releted genes involved in the same process. The rationale behind our approach is that gene expression is largely controlled at the transcriptional level through the interactions between transcription factors and cis-regulatory elements. Gene On...
متن کاملکنترل ژنتیکی گلدهی در گیاه آرابیدوپسیس (Arabidopsis thaliana)
انتقال از رشد رویشی به فاز زایشی از تحولات مهم در زندگی گیاهان می‌باشد. این پدیده در گیاهان عالی تحت تاثیر بسیاری از عوامل ژنتیکی و فیزیولوژیکی می‌باشد. شناسایی این عوامل یکی از اهداف مهم در اصلاح بسیاری از گیاهان می‌باشد. در دهه‌های اخیر گیاه آرابیدوپسیس به عنوان یک گیاه مدل در بسیاری از مطالعات مربوط به عمل گلدهی به کار رفته است و بسیاری از مسیرهای مربوط به کنترل گلدهی در این گیاه مشخص شده اس...
متن کاملکنترل ژنتیکی گلدهی در گیاه آرابیدوپسیس (Arabidopsis thaliana)
انتقال از رشد رویشی به فاز زایشی از تحولات مهم در زندگی گیاهان می‌باشد. این پدیده در گیاهان عالی تحت تاثیر بسیاری از عوامل ژنتیکی و فیزیولوژیکی می‌باشد. شناسایی این عوامل یکی از اهداف مهم در اصلاح بسیاری از گیاهان می‌باشد. در دهه‌های اخیر گیاه آرابیدوپسیس به عنوان یک گیاه مدل در بسیاری از مطالعات مربوط به عمل گلدهی به کار رفته است و بسیاری از مسیرهای مربوط به کنترل گلدهی در این گیاه مشخص شده اس...
متن کاملکلن کردن ژنRGL2 از DNA ژنومی آرابیدوپسیس (Arabidopsis thaliana)
یکی از ژنهایی که در سنتز جیبرلین در گیاه شناخته شده و موقعیت آنها در ژنوم آرابیدپسیس مشخص شده است، RGL2 می‌باشد که در این بررسی کلن گردید. با استخراج DNA از آرابیدوپسیس، اکوتیپ کلمبیا و استفاده از آغازگرهای اختصاصی که بر اساس توالی ژن مورد نظر ساخته شده بودند، این ژن تکثیر شد. پلاسمید PET-32a (+)و ژن تکثیر شده با استفاده از دو آنزیم برشی خاص به نامهای Nco I و Sal I برش داده شدند. پس از اتصال ژ...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Bioinformatics
سال: 2008
ISSN: 1367-4803,1460-2059
DOI: 10.1093/bioinformatics/btn417